每天早上肚子疼，大便后就好了，可能与以下原因有关。
1.五更泻：中医认为，每天清晨鸡鸣时分（五更）出现腹痛泄泻，是肾阳虚衰的典型症状，又名肾泄。这种腹泻以晨起腹痛肠鸣即泻、泻后痛减、大便稀薄为特点，常伴有形寒肢冷、腰膝酸软、脘腹冷痛等症状。可用四神丸、附子理中丸等药物治疗。
2.肠易激综合征：这是一种以腹痛或腹部不适伴排便习惯改变为特征的功能性肠病。患者常有腹痛、腹胀、排便习惯和（或）大便性状改变，而缺乏胃肠道结构和生化异常。精神心理因素、肠道感染、食物不耐受、胃肠激素、炎症介质等都可能与发病有关。治疗方法包括调整饮食、心理治疗、药物治疗等。
3.肠道器质性病变：如溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠道肿瘤等，也可能导致每天早上肚子疼，大便后缓解。此外，一些其他系统的疾病，如内分泌疾病（甲状腺功能亢进）、肝胆疾病等，也可能引起肠道功能紊乱，出现类似症状。
如果这种情况经常发生，或者伴有其他症状，如大便带血、消瘦、恶心、呕吐等，建议及时就医，进行相关检查，如大便常规、肠镜等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。