毛囊炎可以用外用药物来治疗，比如莫匹罗星软膏，一般轻度的毛囊炎使用这类药物涂抹后，几天内就能看到改善。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏：适用于细菌感染引起的毛囊炎，它能抑制细菌蛋白质的合成，从而发挥抗菌作用。对于单个的毛囊炎脓疱，清洁皮肤后涂抹适量药膏，一天使用2 - 3次。夫西地酸乳膏：主要针对革兰阳性球菌引起的毛囊炎，对耐药金黄色葡萄球菌也有效。使用时取适量药膏均匀涂抹在患处，每天2 - 3次。
抗真菌类药物
酮康唑乳膏：如果是真菌感染导致的毛囊炎，像马拉色菌引起的，酮康唑乳膏就很适用。它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌代谢。使用时清洁患部后，薄薄涂抹一层，一天1 - 2次。特比萘芬乳膏：同样用于治疗真菌性毛囊炎，通过抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜的合成。用法是清洗患处后，取适量乳膏涂抹，每日1次。
中药外用药
金黄散：可以用醋或蜂蜜调成糊状，敷在毛囊炎患处，有清热解毒、消肿止痛的作用。一般一天敷1 - 2次，能缓解毛囊炎引起的红肿热痛等症状。鱼石脂软膏：有消肿、防腐及温和的刺激作用，适用于毛囊炎初期红肿阶段。使用时将软膏涂抹在患处，一天1次，能促进炎症消退。
注意事项
在使用外用药前，要先清洁皮肤，保持患处干燥。如果毛囊炎症状严重，比如出现发热、多个毛囊同时感染等情况，单纯外用药物可能不够，需要配合口服药物或者其他治疗方法，这时要及时就医，不要自行盲目用药。同时，对于儿童使用外用药要谨慎，最好在医生指导下使用，避免药物接触到眼睛等敏感部位。