如果怀疑自己存在肛门疾病，可以考虑以下科室进行检查：
1.肛肠科：这是专门诊断和治疗肛门疾病的科室。医生会进行肛门指诊、肛门镜等检查，以确定是否存在痔疮、肛裂、肛瘘、肛周脓肿等疾病。
2.消化内科：如果肛门疾病与消化系统有关，如溃疡性结肠炎、克罗恩病等，医生可能会建议到消化内科进行检查和治疗。
3.结直肠外科：对于一些较为严重的肛门疾病，如直肠癌、肛管癌等，需要进行手术治疗的，医生可能会建议到结直肠外科进行治疗。
4.皮肤科：肛门周围的皮肤疾病，如湿疹、股癣等，也可以到皮肤科进行诊断和治疗。
5.其他科室：在一些情况下，肛门疾病可能与其他系统的疾病有关，如糖尿病、神经系统疾病等，医生可能会建议到相应的科室进行检查和治疗。
需要注意的是，不同医院的科室设置可能会有所不同，具体挂哪个科室可以咨询医院的导医台或医生。此外，在进行肛门检查前，需要注意以下几点：
1.保持肛门清洁：检查前一天应避免食用辛辣、刺激性食物，以及饮酒，保持肛门清洁。
2.告知医生病史：在进行检查前，应告知医生自己的病史，如是否有痔疮、肛裂、肛瘘等疾病，以及是否有其他慢性疾病。
3.放松心情：检查时应放松心情，避免紧张和焦虑，以配合医生的检查。
总之，如果怀疑自己存在肛门疾病，应及时到医院就诊，进行相关的检查和治疗。