男性生殖器上长水泡的原因有很多，常见的有生殖器疱疹、包皮龟头炎、珍珠状丘疹等。以下是一些可能的治疗方法：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。治疗方法包括抗病毒药物（如阿昔洛韦、伐昔洛韦等）、局部外用药物（如炉甘石洗剂、阿昔洛韦乳膏等）和对症治疗（如止痛、止痒等）。此外，患者应注意休息，避免劳累，保持局部清洁，避免搔抓，防止感染扩散。
2.包皮龟头炎：可由细菌、真菌、滴虫等感染引起，也可与局部刺激、过敏等因素有关。治疗方法根据病因不同而异。如果是细菌感染，可使用抗生素（如红霉素、百多邦等）；如果是真菌感染，可使用抗真菌药物（如克霉唑、达克宁等）；如果是过敏引起，可使用抗过敏药物（如氯雷他定、西替利嗪等）。同时，患者应注意局部清洁，勤换内裤，避免不洁性生活。
3.珍珠状丘疹：是一种良性病变，可能与生理发育变异、局部刺激等因素有关。一般不需要治疗，如果患者有治疗需求，可通过激光、冷冻等方法去除。
4.其他：男性生殖器上长水泡还可能与其他疾病有关，如梅毒、尖锐湿疣等。这些疾病需要进行相应的检查和治疗。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据患者的具体情况而定。如果男性生殖器上长水泡，建议及时就医，明确诊断后，在医生的指导下进行治疗。同时，患者应注意个人卫生，避免不洁性生活，避免搔抓和摩擦，以免加重病情。