有肛门湿疹可以通过一般治疗、药物治疗等方式来处理。一般来说，要保持肛门局部清洁干燥，每次排便后最好用温水清洗肛门，每天清洗次数可根据情况2 - 3次左右。
一般治疗方面
避免刺激因素：要尽量避免搔抓肛门部位，因为搔抓会进一步加重湿疹症状，可能导致皮肤破损、感染等情况。还要避免使用刺激性强的肥皂、沐浴露清洗肛门周围，选择温和、无刺激的清洁产品。另外，要穿宽松、棉质的内裤，减少衣物对肛门局部的摩擦。调整饮食： 尽量少吃辛辣、刺激性食物，像辣椒、花椒、芥末等，这类食物可能会加重肛门湿疹的瘙痒等症状。同时，要避免饮酒，酒精也会对肛门局部产生刺激。可以多吃一些富含维生素的新鲜蔬菜和水果，如苹果、香蕉、菠菜、西兰花等，有助于维持皮肤的健康。
药物治疗方面
外用药物：常用的有糖皮质激素药膏，如氢化可的松软膏，它可以起到抗炎、止痒的作用，但要注意不能长期大面积使用，一般短期使用控制症状。还有钙调磷酸酶抑制剂，如他克莫司软膏，适用于面部、颈部等皮肤薄嫩部位，以及不能使用糖皮质激素的部位，不过使用初期可能会有轻微的灼热感等。口服药物：抗组胺药物可以缓解瘙痒症状，比如氯雷他定片，成人一般每天服用1次，每次10毫克，但2岁以下儿童使用需谨慎，应在医生指导下用药。如果肛门湿疹伴有继发感染，可能需要口服抗生素，如头孢类抗生素，但使用抗生素要严格遵医嘱，不能自行滥用。
中医治疗辅助
中药外洗：可以选用一些清热解毒、祛风止痒的中药进行外洗，比如用黄柏、苦参、蛇床子等中药煎水后外洗肛门局部，一般每天可进行1 - 2次外洗，每次外洗时间15 - 20分钟左右，能起到一定的清热燥湿、止痒的效果。中医药膏：有些中医药膏也可用于肛门湿疹的治疗，如除湿止痒软膏等，具有清热除湿、祛风止痒的作用，涂抹在肛门湿疹患处，能缓解瘙痒、红肿等症状，但使用前最好咨询中医医生的建议。