肛门息肉的治疗方法需根据息肉的大小、数量等情况来定，一般较小的息肉可通过内镜下治疗等方式处理。
内镜下治疗方式
高频电凝切除术：对于较小的有蒂息肉，可通过内镜将高频电刀引入，利用高频电流产生的热效应将息肉切除，通常能一次性解决问题，创伤相对较小。内镜下黏膜切除术（EMR）：适用于较大的无蒂息肉或扁平息肉，通过注射生理盐水使病变黏膜隆起，然后用圈套器将其切除，术后需要密切观察有无出血等情况。
手术治疗情况
开腹手术：如果肛门息肉较大且位置较深，内镜下治疗困难时可能需要开腹手术切除。这种手术创伤相对较大，术后恢复时间较长，一般在息肉体积较大、内镜无法处理的情况下才会采用。肛门镜下手术：对于肛门部位的息肉，可通过肛门镜暴露息肉后进行切除，手术相对更直接针对肛门局部的病变，能准确切除息肉，但术后也需要注意局部护理，防止感染等并发症。
药物辅助治疗方面
局部用药：术后可能会使用一些局部抗炎、促进创面愈合的药物，如痔疮膏等，起到减轻局部炎症反应、促进伤口恢复的作用，但药物主要是辅助治疗，不能替代手术等主要治疗方式。不过一般这类局部用药不会有严重的全身性副作用，但要注意按照医生指导使用，避免误用导致不良后果。抗生素使用：如果息肉切除后有感染风险或已经发生感染，可能会短期使用抗生素，如头孢类抗生素等，但使用抗生素要严格遵循医嘱，避免滥用导致耐药等问题，同时要注意自身有无过敏等情况。