脚内侧有骨头凸起可能是由生理性因素、拇外翻、骨刺等原因导致。具体如下：
一、生理性因素：若患者较瘦，可能就会使脚内侧骨头显得凸起，这属于正常生理现象，无需特殊治疗。
二、拇外翻：
1.长期穿着高跟鞋、鞋头较尖的鞋子等，会使脚内侧骨骼受挤压，进而出现局部红肿、疼痛等表现。
2.治疗上，可通过佩戴矫形器来改善，必要时可采取软组织手术治疗。
三、骨刺：
1.骨刺是骨组织自我修复的产物，会沿骨骼边缘生长形成骨性突起，其形成与年龄、劳损、创伤等因素有关，可能会有局部疼痛、麻木、关节活动受限等症状。
2.对于症状较轻者，可通过局部热敷、按摩缓解，也可遵医嘱使用对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗。
此外，还可能与腱鞘囊肿、骨软骨瘤病等有关，建议及时就医诊断。
总之，当发现脚内侧有骨头凸起时，要及时明确原因，根据具体情况采取相应的处理措施。