夜里肛门瘙痒的原因有多种。一般来说，约30% - 50%的肛门瘙痒与局部皮肤病变有关。
局部皮肤病变因素
肛周湿疹：这是常见原因之一。多因局部潮湿、过敏等引起，患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，夜间瘙痒往往更明显，搔抓后可能导致皮肤破损、渗出。股癣：由真菌感染引起，可蔓延至肛周，表现为环状或半环状的红斑，边缘有丘疹、水疱，伴有瘙痒，夜间瘙痒感可能加重。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌蛲虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒。尤其是孩子入睡后1 - 3小时，能明显感觉到肛门周围奇痒。蛔虫等其他肠道寄生虫：虽然相对蛲虫感染引起夜间肛门瘙痒的情况没那么典型，但也可能间接导致肛周不适和瘙痒。
全身性疾病因素
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，皮肤含糖量升高，容易滋生细菌和真菌，引发肛周瘙痒。同时，高血糖状态会使神经末梢受到刺激，也可能加重瘙痒症状。肝胆疾病：如肝硬化、胆石症等，由于胆汁淤积，血液中胆盐含量升高，会沉积在皮肤，刺激神经末梢，导致全身皮肤瘙痒，包括肛门周围。
不良生活习惯因素
不注意肛周清洁：如果晚上睡前没有清洗肛门部位，污垢、汗液等刺激肛周皮肤，就容易引起瘙痒。尤其是肥胖者，肛周易潮湿，更需注意清洁。穿着不恰当：穿着紧身、不透气的内裤或裤子，会使肛周局部温度升高、湿度增大，不利于皮肤呼吸，容易诱发瘙痒，夜间这种不适可能更明显。