祛痘常用的药物有抗生素类、维A酸类等。比如抗生素类中的夫西地酸乳膏，对轻中度炎症性痘痘有一定效果；维A酸类的阿达帕林凝胶，一般需要连续使用数周才能看到较好改善。
抗生素类药物
夫西地酸乳膏： 主要针对痤疮丙酸杆菌等细菌起作用，能抑制细菌蛋白质合成，从而达到抗菌消炎祛痘的效果。它适用于炎症比较明显的痘痘，像红肿、有脓疱的那种痘痘。不过，对夫西地酸过敏的人不能用。克林霉素磷酸酯凝胶： 同样是通过抑制细菌蛋白质合成来发挥抗菌作用，可用于治疗寻常痤疮。使用时要注意避免接触眼睛和其他黏膜部位，如口、鼻等。
维A酸类药物
阿达帕林凝胶： 属于第三代维A酸类药物，能调节表皮角质形成细胞的分化，改善毛囊皮脂腺导管角化，溶解微粉刺和粉刺。一般建议晚上睡前使用，因为用药后可能会有轻度刺激反应，如皮肤发红、脱屑等，刚开始使用时要低浓度小面积使用，建立耐受后再逐步增加使用范围。异维A酸凝胶： 适用于重度且对其他治疗方法（如系统用康抗生素）无效的聚合性痤疮、结节囊肿性痤疮等。但它有比较多的禁忌和副作用，比如可能会引起皮肤干燥、脱屑，还可能导致肝功能异常等，所以必须在医生严格指导下使用，而且孕妇禁用，因为会导致胎儿畸形。
过氧化苯甲酰类药物
过氧化苯甲酰凝胶： 可以缓慢释放新生态氧和苯甲酸，具有杀灭痤疮丙酸杆菌、抗炎的作用，还能轻度剥脱角质。它对炎性痘痘和非炎性痘痘都有一定效果，不过可能会引起皮肤刺激，如发红、刺痛等，所以开始使用时要从小面积开始，慢慢建立耐受。
其他药物
二硫化硒洗剂： 具有抗真菌、抗皮脂溢出作用，也可用于祛痘。可以将其稀释后用来清洗脸部，不过使用后要注意清洗干净，避免残留刺激皮肤。但如果皮肤有破损就不适合使用了。