小儿发烧灌肠的好处主要包括易于小儿接受、避免刺激、吸收快速、便于给药等，而坏处主要有肠道易受损、易腹泻、易菌群紊乱以及易继发感染等。
一、灌肠的好处：
1.小儿往往对口服药物反感，而灌肠就避免了因口服药物导致的哭闹、呕吐等情况；
2.药物可直接通过直肠吸收，这样就避免了药物对胃肠黏膜的刺激；
3.直肠血管丰富吸收快，能够快速起到退烧的作用；
4.灌肠可以杀死肠道里的细菌病毒，促进排泄，对于有便秘的孩子还具有通便作用。
二、灌肠的坏处：
1.灌肠属于侵入性操作，有可能导致小儿肠道损伤；
2.会刺激肠蠕动从而引起腹泻；
3.药物进入肠道深处容易产生污染；
4.菌群失调造成内环境改变，会使肠道功能变差。同时，如果灌肠时存在大便，会影响药物吸收，且剂量也不好把握。
总之，小儿发烧灌肠既有一定好处，也存在一些弊端，在实际应用中需要谨慎权衡和合理选择。