宝宝胃肠功能性紊乱可通过饮食治疗，也可借助药物治疗等。
一、饮食调理：宝宝胃肠功能性紊乱可进行饮食方面的调理，采用少量多餐的喂养方式，暂时先不添加其他辅食。要是母乳喂养的宝宝，哺乳者要避免食用辛辣刺激性食物以及油炸食品，应选择易消化的食物为主。
二、药物治疗：宝宝胃肠功能性紊乱还能够通过药物来医治，可以服用益生菌来调节胃肠道菌群，例如布拉氏酵母菌散、双岐杆菌等。建议用40℃以后的温水进行服用，且和其他药物同服时，至少要间隔两个小时以上，这样能保证益生菌的活性，从而使治疗效果更好。
如果出现宝宝胃肠功能性紊乱的情况，建议要及时前往医院就诊，积极配合医生的治疗，切不可私自用药，以免延误病情，对宝宝的身体健康造成影响。
总结概况提示：宝宝胃肠功能性紊乱有饮食和药物等治疗方法，饮食上要注意喂养方式和哺乳者的饮食，药物治疗可选择合适的益生菌并注意服用方法，出现状况应及时就医，不可盲目用药。