黄体酮低可能会在不同人群中出现不同症状。对于女性来说，在孕期黄体酮低可能影响妊娠。非孕期女性黄体酮低也会有表现。
月经方面的症状
月经周期紊乱： 黄体酮低可能导致月经周期变得不规律，比如原本28天左右的周期可能会延长或缩短。有的女性原本月经周期比较稳定，黄体酮低后可能出现提前7天以上或者推迟7天以上的情况。经量异常： 还可能出现月经量的改变，有的女性会出现月经量减少，原本正常的经量明显变少；也有部分女性会出现月经量增多，经期出血时间延长等情况。
孕期相关症状
早期流产风险增加： 在怀孕早期，如果黄体酮水平低，就容易增加流产的风险。有研究表明，孕早期黄体酮水平不足的孕妇，流产发生率比黄体酮水平正常的孕妇高出很多。阴道少量出血： 有些黄体酮低的孕妇可能会出现阴道少量出血的情况，血液颜色可能是暗红色或者褐色，同时可能伴有下腹部隐痛等不适症状。
其他身体表现
基础体温变化： 女性的基础体温会随着黄体酮的变化而改变，黄体酮低时基础体温可能会低于正常范围。正常情况下，排卵后基础体温会升高0.3 - 0.5℃，如果黄体酮低，这个体温升高的情况可能不明显或者体温升高幅度不够。乳房不适： 部分女性可能会出现乳房胀痛等不适症状有所减轻的情况，原本黄体酮正常时乳房可能有较明显的胀痛感，黄体酮低时这种胀痛感会相对减轻。