试管移植失败后，胚胎的去向通常有几种情况。一般来说，移植失败后未着床的胚胎会随着女性的身体代谢排出体外，这个过程通常比较自然，就像月经来潮时的一些组织排出类似，一般不会对身体造成明显的不良影响。
被身体自然吸收
部分未着床的胚胎会被女性的身体逐渐自然吸收。身体会通过自身的生理调节机制，将胚胎相关的物质进行分解代谢，就如同身体处理一些自身产生的废弃物质一样，这个过程通常不需要特殊的干预，身体会自行完成。一般在移植后短时间内，如果胚胎未着床，身体就会启动吸收过程。
作为医疗废弃物处理
在一些医疗机构中，如果患者没有特殊要求保留胚胎，未着床的胚胎会被作为医疗废弃物按照相关规定进行处理。医疗机构会遵循严格的医疗废物处理流程，确保其不会对环境等造成不良影响。比如会通过特定的消毒等程序后进行规范的处置。
患者可选择保留但有条件限制
有些患者可能会选择保留胚胎，但这通常有一定的时间限制等条件。例如在一定的保存期限内可以保留，不过保存也需要满足相应的存储条件等要求。但一般情况下，大部分移植失败后的胚胎如果患者没有特殊要求，主要还是通过自然吸收或者按医疗废弃物处理的方式来处理。