结膜炎的治疗需根据不同类型选择合适方式，一般来说，细菌性结膜炎可使用抗生素类药物，病毒性结膜炎可使用抗病毒药物等。比如细菌性结膜炎常用的抗生素眼药水有左氧氟沙星滴眼液等，一般用药后数天内症状会有所缓解。
细菌性结膜炎的治疗
局部使用抗生素： 对于细菌性结膜炎，常用的抗生素眼药水有左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等。这些眼药水能抑制细菌生长繁殖，减轻炎症。比如左氧氟沙星滴眼液，它通过抑制细菌DNA旋转酶和拓扑异构酶Ⅳ的活性，阻碍细菌DNA复制来发挥抗菌作用。保持眼部清洁： 患者要注意保持眼部清洁，可以用生理盐水清洗眼部，每天清洗1 - 2次，清除眼部分泌物，有助于减轻炎症反应，促进病情恢复。
病毒性结膜炎的治疗
使用抗病毒药物： 病毒性结膜炎可选用阿昔洛韦滴眼液等抗病毒药物。阿昔洛韦能干扰病毒DNA多聚酶，抑制病毒DNA的合成，从而发挥抗病毒作用。避免交叉感染： 病毒性结膜炎具有传染性，患者要注意避免与他人共用毛巾、脸盆等物品，防止交叉感染。在家中，用过的毛巾等物品要定期进行消毒处理，比如用开水烫洗等。
过敏性结膜炎的治疗
远离过敏原： 首先要尽量找出过敏原并远离，比如花粉过敏者在花粉季节尽量减少外出，避免接触花粉；尘螨过敏者要保持室内清洁，经常清洗床上用品等。使用抗过敏药物： 可使用色甘酸钠滴眼液等抗过敏药物，色甘酸钠能稳定肥大细胞细胞膜，阻止肥大细胞释放组胺、白三烯等过敏介质，从而减轻过敏症状。