卵巢早衰是指女性在40岁以前出现卵巢功能减退，其原因较为复杂。据统计，约10% - 20%的卵巢早衰与遗传因素有关。
遗传因素方面
染色体异常： 某些染色体的数目或结构异常会引发卵巢早衰。比如X染色体异常，包括特纳综合征（45，XO）及其变异型，这类染色体异常会影响卵巢的正常发育和功能，导致卵巢早衰发生的概率增加。基因突变： 一些特定基因的突变也与卵巢早衰相关，例如FMR1基因、BMP15基因等的突变，会干扰卵巢的正常生理过程，使得卵巢功能提前衰退。
自身免疫因素方面
免疫系统攻击卵巢： 自身免疫性疾病会导致免疫系统错误地攻击卵巢组织。像自身免疫性甲状腺疾病，患者体内产生的自身抗体可能同时攻击甲状腺和卵巢，影响卵巢的内分泌和排卵功能，进而引发卵巢早衰。其他自身免疫病关联： 类风湿关节炎等自身免疫性疾病也可能与卵巢早衰存在关联，免疫系统的异常激活使得卵巢组织受到损伤，致使卵巢功能过早衰退。
医源性因素方面
手术影响： 卵巢部位的手术，如卵巢囊肿剥除术、输卵管癌根治术等，可能会破坏卵巢的正常结构和功能，从而引起卵巢早衰。尤其是过度切除卵巢组织时，对卵巢功能的影响更为显著。放疗化疗影响： 女性在接受盆腔部位的放疗，或者是使用化疗药物治疗某些恶性肿瘤时，放疗和化疗的射线、药物等可能会损伤卵巢的卵泡，导致卵泡数量减少，卵巢功能提前衰退，一般在化疗后数月至数年可能出现卵巢早衰的表现。