衣原体支原体感染的症状与患病部位相关，常表现为咳嗽、眼睛充血、排尿异常等。
一、咳嗽：当衣原体支原体感染呼吸道部位时，患者会有身体发热、咳嗽以及咽喉疼痛等状况。这是因为病原体侵袭呼吸道，引发炎症反应，从而导致这些症状的出现。身体发热是机体对感染的一种免疫反应；咳嗽则是呼吸道受刺激后的一种保护性反射动作，以试图排出病原体和分泌物；咽喉疼痛则是由于炎症刺激咽喉部所致。
二、眼睛充血：若衣原体支原体感染眼睛部位，患者会出现结膜充血、容易流泪等表现，部分患者还可能有眼睛异物感。结膜充血是由于眼部的血管扩张，血流增加；容易流泪是因为炎症刺激使泪腺分泌增加；而眼睛异物感则是眼部不适的一种感觉。
三、排尿异常：当患者生殖器部位遭受衣原体支原体感染时，可能诱发炎症性疾病，致使患者出现尿频、尿急等排尿异常症状，部分患者还会有排尿过程异常疼痛的情况。尿频是指排尿次数增多；尿急是指一有尿意即迫不及待地需要排尿；排尿疼痛则是由于炎症刺激尿道等引起。
衣原体支原体感染后，患者需要依据具体症状选取适宜的方法进行治疗。
总之，对于衣原体支原体感染，应注意其症状因感染部位不同而各异，要及时诊断和治疗。