前庭大腺囊肿主要是由于前庭大腺管开口堵塞，分泌物积聚而形成。前庭大腺管开口堵塞的原因有多种，比如在分娩时，会阴与阴道裂伤后形成的瘢痕组织阻塞腺管口；或者是前庭大腺炎急性炎症消退后，腺管被脓液阻塞，渗出物逐渐转为清液而形成囊肿。
腺管阻塞的常见原因
炎症因素： 前庭大腺受到细菌等病原体感染引发炎症时，炎症急性期，腺管周围组织肿胀，或渗出物阻塞腺管开口，导致分泌物引流不畅、积聚，从而形成囊肿。例如，当女性不注意外阴局部卫生，病原体容易侵入前庭大腺引发炎症。损伤因素： 分娩时会阴部及阴道裂伤，形成的瘢痕组织可能会阻塞前庭大腺管；或者是进行会阴侧切等手术时，损伤了前庭大腺管，使得腺管开口处狭窄，分泌物排出受阻，进而形成囊肿。
腺体自身因素
腺管狭窄或闭锁： 前庭大腺本身的腺管比较细长，部分女性可能存在腺管先天性狭窄或闭锁情况，这样就会导致分泌物无法正常排出，长时间积聚后就容易形成囊肿。一般这种先天性的腺管问题在青春期后可能逐渐显现出来。分泌物黏稠： 前庭大腺分泌的液体如果本身比较黏稠，也容易阻塞腺管。当腺体分泌功能正常，但分泌物排出困难时，就会使分泌物在腺管内积聚，逐渐形成囊肿。比如一些内分泌因素可能会影响前庭大腺分泌物的性状，导致其变得黏稠。
其他可能情况
性生活影响： 过于频繁的性生活等因素也可能对前庭大腺管产生一定影响，虽然不是直接导致阻塞的主要原因，但在一定程度上可能会增加腺管阻塞的风险。不过这种情况相对来说不是最常见的引发前庭大腺囊肿的因素，但也是需要考虑的一方面。