毛囊炎是毛囊的炎症反应，常用的外用药膏有很多，一般可以根据病因选择合适的药膏。细菌感染引起的毛囊炎，常用莫匹罗星软膏等；真菌感染引起的毛囊炎，常用酮康唑乳膏等。一般局部涂抹药膏就有较好效果，多数情况下经过规范用药1-2周可改善症状。
细菌感染性毛囊炎适用药膏
金黄色葡萄球菌感染： 莫匹罗星软膏是常用的抗细菌药膏，它能抑制细菌蛋白质的合成，从而发挥杀菌作用。一般局部涂抹，每天2-3次。需要注意的是，对莫匹罗星或其他含聚乙二醇软膏过敏者禁用。表皮葡萄球菌感染： 夫西地酸乳膏也可用于此类毛囊炎，它通过抑制细菌的蛋白质合成来杀菌。使用时取适量涂于患处，一日2-3次。孕妇及哺乳期妇女需在医生指导下使用。
真菌感染性毛囊炎适用药膏
马拉色菌感染： 酮康唑乳膏就比较适用，它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的代谢。一般外用，涂于患处，一日2次。不过，对酮康唑、咪唑类药物过敏者禁用，孕妇及哺乳期妇女应权衡利弊后使用。小孢子菌感染： 联苯苄唑乳膏也可用于治疗，它能抑制真菌细胞膜的合成，对皮肤癣菌等有抗菌作用。外用时，清洁患处后，取适量涂于患处，一日1次。使用过程中若出现局部皮肤刺激如烧灼感等，应停药并洗净。
其他情况的药膏选择
症状较轻的毛囊炎： 还可以使用碘酊，它能使细菌蛋白质变性，从而杀灭细菌。用棉签蘸取少量碘酊，涂抹在患处，注意不要涂到正常皮肤上，以免刺激。但碘过敏者禁用，婴幼儿慎用。有破损的毛囊炎： 可以先用碘伏消毒，然后再涂抹抗生素药膏，如红霉素软膏。红霉素软膏对大多数革兰阳性菌、部分革兰阴性菌及一些非典型致病菌有抗菌作用。使用时局部外用，涂于患处，一日2次。对红霉素过敏者禁用。