生理期结束后有少量咖啡色分泌物，可能是以下原因导致：
1.黄体功能萎缩不全：黄体功能萎缩不全可能导致子宫内膜不规则脱落，使月经周期缩短，经期延长，出现月经后淋漓不尽的现象。
2.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种良性病变，常表现为月经间期出血、经量增多、经期延长等症状。
3.子宫肌瘤：黏膜下肌瘤、较大的肌壁间肌瘤可导致子宫腔面积增大，子宫收缩不良，引起月经经期延长、经量增多。
4.宫内节育器：宫内节育器可能引起子宫内膜无菌性炎症，导致月经后淋漓不尽。
5.其他：排卵期出血、子宫内膜异位症、宫颈癌前病变、宫颈癌等也可能出现类似症状。
如果出现生理期结束后有少量咖啡色分泌物的情况，建议及时就医，进行相关检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
在就医前，应注意个人卫生，保持外阴清洁，避免性生活及盆浴。同时，应注意休息，避免过度劳累，保持心情愉悦。如果出血量较多或持续时间较长，应及时就医。