甲状腺结节一般不会自行消失，不过可以通过一些方式来控制其发展或处理。目前并没有能让所有甲状腺结节都消失的特定方法，但可以从以下方面入手。
观察随访
对于大部分甲状腺良性结节，如果结节较小且没有引起明显症状，医生可能会建议定期观察随访。一般每隔6-12个月进行一次甲状腺超声检查，观察结节的大小、形态等变化。比如一些体积小于1厘米的良性甲状腺结节，若无特殊情况，可先通过定期超声监测来了解情况。
药物治疗
如果是由甲状腺功能亢进引起的甲状腺结节，可能会使用抗甲状腺药物，如甲巯咪唑等。但药物治疗需要在医生指导下进行，并且一般需要较长时间服用，而且药物治疗并不能使所有甲状腺结节消失，主要是控制甲状腺功能亢进的症状以及相关指标。例如，使用甲巯咪唑治疗甲亢相关甲状腺结节时，要定期复查甲状腺功能，根据指标调整药物剂量。
手术治疗
对于一些较大的甲状腺结节，或者怀疑有恶性倾向的结节，可能需要进行手术治疗。比如结节直径大于4厘米，或者超声下结节有微小钙化、边界不清、纵横比大于1等可疑恶性表现时，通常会考虑手术切除。手术可以直接去除结节，但术后也需要进行相应的后续观察和处理。
放射性碘治疗
如果是甲亢伴发的甲状腺结节，且适合放射性碘治疗的情况，可使用放射性碘破坏甲状腺组织，减少甲状腺激素的分泌，从而对相关结节产生影响。不过放射性碘治疗也有一定的适应证和禁忌证，需要医生评估后才能决定是否采用。比如某些不适合手术的甲亢患者可能会选择放射性碘治疗来改善甲状腺结节相关的甲亢症状。