根据你提供的信息，小便时尿道刺痛连着肚脐疼可能由以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，常由细菌感染引起。除了尿痛和肚脐疼，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，应注意多饮水，促进排尿，有助于缓解症状。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也常由细菌感染引起。除了尿痛和肚脐疼，还可能伴有尿频、尿急、下腹部疼痛等症状。治疗膀胱炎的方法与尿道炎类似，也是使用抗生素。此外，还可以使用一些缓解症状的药物，如布洛芬等。
3.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，常由细菌感染或其他原因引起。除了尿痛和肚脐疼，还可能伴有尿频、尿急、会阴部疼痛、性功能障碍等症状。治疗前列腺炎需要根据具体情况选择合适的方法，如使用抗生素、物理治疗、中药治疗等。
4.其他原因：除了上述疾病，还有其他一些原因也可能导致小便时尿道刺痛连着肚脐疼，如泌尿系统结石、泌尿系统肿瘤等。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据个人的症状、体征以及相关检查来确定。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确诊断并进行相应的治疗。此外，在治疗过程中，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免过度劳累和饮酒等。