治疗胆结石的方法有多种，对于无症状的胆结石，一般每6-12个月复查一次腹部超声，观察结石变化。而有症状或符合手术指征的胆结石，常见的治疗方法如下：
药物溶石治疗
熊去氧胆酸： 适用于胆固醇结石，需连续服用6个月以上，通过抑制胆固醇合成并增加胆汁中胆固醇的排泄，使结石逐渐溶解。但一般来说，完全溶解结石的概率有限，大约在10%-20%左右，而且停药后有复发可能。鹅去氧胆酸： 也可用于胆固醇结石的溶解，但副作用相对较多，如可能引起肝脏损害等，现在临床应用相对少一些。
手术治疗
腹腔镜胆囊切除术
适用情况： 是治疗有症状胆结石的常用手术方式，对于大多数胆囊功能基本正常的患者较为合适。手术过程： 通过在腹部打几个小孔，插入腹腔镜和手术器械，切除胆囊。一般术后恢复较快，住院时间通常在3-7天左右，术后1周左右可基本恢复日常活动。
开腹胆囊切除术
适用情况： 主要用于一些复杂情况，比如胆囊炎症严重与周围组织粘连紧密、腹腔镜手术困难的患者等。手术过程： 切口较大，一般在右上腹做一个较长的切口，然后切除胆囊。术后恢复相对较慢，住院时间可能在1周以上，术后伤口疼痛等恢复时间也比腹腔镜手术长。
保胆取石术
适用情况： 适用于胆囊功能良好、有保留胆囊意愿的患者，如结石较小、数量较少的胆囊结石患者。手术过程： 切开胆囊取出结石后再缝合胆囊。但术后结石复发的概率较高，有研究显示术后1年复发率可能在20%左右，5年复发率可达30%-40%。
其他治疗方式
体外冲击波碎石： 利用体外冲击波聚焦后击碎体内的胆结石，使其随尿液排出。但这种方法适用于结石直径较小（一般小于2cm）的胆固醇结石，而且碎石成功率不是很高，并且可能会引起肾脏等周围组织的损伤，现在应用也相对有限。