萎缩性胃炎的治疗需根据具体情况选择药物，目前常用的有效药物包括抑酸剂、胃黏膜保护剂等。一般来说，抑酸剂中的质子泵抑制剂是常用的一类，比如奥美拉唑，它能有效抑制胃酸分泌，缓解因胃酸过多引起的不适，通常可以长期使用，但具体使用需遵医嘱。
抑酸类药物
质子泵抑制剂：像奥美拉唑，能特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后一步，从而减少胃酸对胃黏膜的刺激。一般而言，它可有效改善萎缩性胃炎患者胃酸过多导致的烧心、反酸等症状。H₂受体拮抗剂：例如雷尼替丁，通过竞争抑制组胺与胃壁细胞上的H₂受体结合，减少胃酸分泌。它对缓解萎缩性胃炎患者的胃酸相关症状也有一定作用，但作用强度相对质子泵抑制剂稍弱。
胃黏膜保护剂
铋剂：常见的有枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，隔绝胃酸、胃蛋白酶等对胃黏膜的侵袭，还能促进胃黏膜的修复。通常需要连续服用一段时间来发挥较好的保护作用。铝碳酸镁：能迅速中和胃酸，并且吸附胆汁，它不仅可以保护胃黏膜免受胃酸和胆汁的损伤，还能促进胃黏膜前列腺素的合成，对萎缩性胃炎有一定的辅助治疗作用。
抗幽门螺杆菌药物
如果萎缩性胃炎伴有幽门螺杆菌感染，就需要进行抗幽门螺杆菌治疗，常用的是四联疗法，即一种质子泵抑制剂+两种抗生素+一种铋剂。比如质子泵抑制剂选用奥美拉唑，抗生素可以选择阿莫西林和克拉霉素，铋剂选用枸橼酸铋钾。通过根除幽门螺杆菌，有助于改善萎缩性胃炎的病情，但具体用药方案需由医生根据患者的具体情况制定。
其他辅助药物
促胃肠动力药：当萎缩性胃炎患者伴有腹胀等消化不良症状时，可使用多潘立酮，它能促进胃肠蠕动，帮助食物消化，缓解腹胀不适。不过，这类药物需在医生指导下使用，避免长期滥用。补充维生素类药物：对于伴有维生素缺乏的萎缩性胃炎患者，可适当补充维生素，如维生素C、维生素E等，它们具有抗氧化作用，可能对胃黏膜的修复有一定帮助，但也需在医生的指导下合理补充。