阴茎出现一阵一阵疼痛，在临床上主要有以下这些情形：
一、尿路感染：即阴茎的尿路产生感染，当炎症发作时，就可能引发一阵一阵的疼痛。这主要是因为细菌等病原体侵袭尿路，导致尿路黏膜出现炎症反应，从而引起疼痛。
二、阴茎硬结症：是指由于阴茎海绵体（特别是阴茎白膜）发生纤维化，并形成纤维斑块，这样在触摸阴茎时能够摸到硬结。患有阴茎硬结症的患者在阴茎勃起时，也会出现一阵一阵的疼痛现象。其原因在于硬结会影响阴茎勃起的正常形态和功能，进而导致疼痛。
三、包茎：包茎患者由于阴茎头长期被包皮包裹，在勃起时，包皮可能会对阴茎头形成压迫，从而导致阴茎一阵一阵的疼痛；另外，如果清理不恰当，包茎患者的包皮垢可能会长期积累，进而对阴茎头和尿道产生刺激，引起阴茎一阵一阵的疼痛。
治疗方面的建议如下：
一、尿路感染：可依据医嘱服用抗菌药或抗炎药来进行治疗。常用的药物包括喹诺酮类（如诺氟沙星、氧氟沙星等）、青霉素类（如氨苄西林、阿莫西林等）以及头孢类（如头孢呋辛、头孢哌酮、头孢他啶等）。
二、阴茎硬结症：对于病情较轻的患者，可应用口服药物来阻止病情的发展，常用的药物为抗雌激素类药物，这类药物可起到抗组织纤维化的作用，例如他莫昔芬。而病情严重的病人则需要考虑手术治疗，比如通过手术将纤维斑块切除。
三、包茎：可采用包皮环切术将过长的包皮切除。
总之，当阴茎出现一阵一阵疼痛时，需要及时就医，明确具体原因，并在医生的指导下进行针对性的治疗。