孩子生殖器疼痛，男孩可能是包皮龟头炎、尿道口炎症、外伤所致，女孩则可能是外阴炎或外伤引起。
孩子生殖器疼痛的具体原因如下：
一、包皮龟头炎：对于男孩来说，生殖器疼痛常常是由于包皮过长以及包皮垢的存在，在未注重局部卫生的情况下，导致包皮内的污垢积聚，再加上细菌感染而发病。其表现为包皮红肿、有灼痛感，排尿时疼痛会加重，还可能有脓性分泌物从包皮口流出。
1.（1）包皮过长是重要因素之一。
（2）污垢积聚易引发感染。
二、尿道口炎症：男孩子尿道口发炎，多数是因为包皮过长或者包茎，致使包皮内以及龟头表面出现包皮垢，慢性刺激包皮口或龟头而引起包皮龟头炎，进而导致尿道口发炎。也可能是未注意卫生，没有及时清洗尿道口导致细菌感染。
1.（1）与包皮情况密切相关。
（2）卫生状况不佳可诱发。
三、外伤：不论男孩还是女孩，在小时候都容易发生磕碰，如果生殖器不小心受到撞击，也会引发疼痛，这种情况下通常外观能看到撞伤的痕迹，比如红肿或有明显伤口等。
1.（1）磕磕绊绊可能导致受伤。
（2）外观会有相应表现。
四、外阴炎：女孩子生殖器疼痛有可能是外阴炎，导致患上外阴炎的主要原因是孩子外阴部缺乏脂肪垫和阴毛，阴唇相对较小且薄，相比成年女性更容易受到刺激、损伤以及病原微生物的侵袭。
1.（1）自身生理特点使然。
（2）易受多种因素影响。
孩子生殖器疼痛的注意事项包括：
1.要仔细观察孩子的生殖器有无外伤、红肿以及伤口等异常情况。
2.需注意孩子生殖器的卫生清洁，每天都要用清水清洗干净。
3.一旦发现异常情况必须及时到医院检查，并进行对症治疗。
总之，当孩子出现生殖器疼痛时，要综合考虑可能的原因，并注意相关事项，以便及时发现问题并采取正确的处理措施。