高位截瘫目前尚无完全根治的特效疗法，但可以通过多种方式来改善症状、提高生活质量。一般来说，治疗主要包括康复训练、药物辅助、手术干预等方面。
康复训练方面
物理治疗： 早期可进行关节活动度训练，每天要对患者的各个关节进行数次屈伸等活动，防止关节僵硬挛缩，每次每个关节活动10 - 15次左右。还可以进行体位变换训练，定时帮助患者翻身，比如每2 - 3小时翻身一次，预防压疮。运动功能训练： 针对有部分残留肌力的患者，可以进行肌力训练，利用辅助器械或者患者自身残留力量进行肢体的抬举等训练，增强肌肉力量。例如使用弹力带进行上肢肌力训练，每次训练15 - 20分钟，每天可进行2 - 3次。
药物辅助方面
神经营养药物： 常用的有甲钴胺，它可以促进神经细胞的代谢和修复，有助于神经功能的恢复，一般需要长期服用，可能持续数月甚至更久。还有鼠神经生长因子等，能营养神经，刺激神经细胞的生长，但使用时需要在医生严格评估下进行。缓解痉挛药物： 对于出现肌肉痉挛的患者，可使用巴氯芬等药物，能缓解肌肉过度紧张的状态，但这类药物可能会有嗜睡等副作用，用药期间需密切观察患者反应。
手术干预方面
减压手术： 如果高位截瘫是由于脊柱骨折等原因导致脊髓受压引起的，在合适的时机可能需要进行减压手术，比如脊柱骨折复位内固定联合脊髓减压术，一般在受伤后的72小时内若符合手术指征就可能进行手术，以解除脊髓的压迫，为神经恢复创造条件。神经修复手术： 目前一些前沿的研究中涉及到神经修复手术，但技术还在不断发展完善中，部分医院会针对合适的患者开展相关探索性手术，但成功率和效果因个体差异较大。