月经后第三天行房是否会怀孕，主要与女性的月经周期和排卵情况有关。一般来说，怀孕的可能性较小，但不能完全排除。
1.女性的排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右。排卵日的前5天和后4天，连同排卵日在内共10天称为排卵期。除了月经期和排卵期，其余的时间均为安全期。在安全期行房，受孕的几率较低。
2.但需要注意的是，女性的排卵可能会受到情绪、环境、健康状况等因素的影响，出现提前或推迟的情况。此外，精子在女性体内可能存活3-5天，因此安全期并非绝对安全。
3.如果女性的月经周期不规律，或者存在其他影响排卵的因素，如多囊卵巢综合征、内分泌失调等，那么安全期的计算就不准确，行房时也可能会怀孕。
如果女性担心怀孕，可以采取以下措施：
1.服用紧急避孕药：在无保护措施的性生活后72小时内服用紧急避孕药，可以降低怀孕的风险。但紧急避孕药不能作为常规避孕方法，多次使用可能会导致月经失调等问题。
2.宫内节育器：如果女性已经生育，并且不打算再怀孕，可以考虑在子宫内放置宫内节育器，这是一种长效的避孕方法。
3.其他避孕方法：如使用避孕套、避孕膜等。
总之，月经后第三天行房是否会怀孕，不能一概而论。如果女性对怀孕问题非常担心，或者存在其他影响怀孕的因素，建议咨询医生或妇科专家，进行详细的咨询和检查。同时，也要注意采取有效的避孕措施，保护自己的身体健康。