这种情况可能是尖锐湿疣、传染性软疣、珍珠状阴茎丘疹等疾病导致的，也可能是正常的生理现象，具体如下：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。表现为阴茎根部长出单个或多个淡红色小颗粒，质地柔软，逐渐增大、增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。可伴有瘙痒、疼痛或性交不适。确诊后，可使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗，也可采用激光、冷冻、电灼等物理方法去除疣体。
2.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。好发于儿童和青年人，多见于外生殖器、臀部、下腹部等部位。治疗方法主要是刮除疣体，然后局部外用碘酊等消毒剂。
3.珍珠状阴茎丘疹：是一种发生在阴茎冠状边缘的丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等有关。表现为阴茎冠状边缘有珍珠状、半透明的丘疹，环绕阴茎冠状沟排列成一行或数行，可无自觉症状。一般不需要治疗，也不会对健康造成影响。
4.正常的生理现象：一些男性在阴茎根部可能会出现一些正常的皮肤赘生物，如皮脂腺异位症、系带旁丘疹等，这些通常也是不痛不痒的。
如果发现阴茎根部长了小肉粒，建议及时就医，由医生进行诊断和治疗。在就医前，应注意保持局部清洁，避免搔抓和摩擦，以免疣体扩散或感染。同时，应避免不洁性生活，使用安全套可以有效预防性病的传播。