小腿肌间静脉血栓是下肢深静脉血栓的常见类型，其治疗主要包含一般治疗、药物治疗以及介入治疗等，应在医生指导下进行。
一、一般治疗：
1.制动与缓解症状：需要卧床休息并抬高患肢，使小腿位置高于心脏平面20-30厘米，这样做的目的主要是预防血栓脱落引发肺栓塞。不过卧床休息时间不宜过长，在抗凝治疗的情况下可早期下床活动，病情允许时可穿着弹力袜或使用弹力绷带后起床活动。
二、药物治疗：
1.抗凝治疗：
(1)急性期可使用肝素与低分子肝素治疗，后续可采用华法林等口服药物进行长期抗凝治疗。虽然抗凝治疗不能溶解已形成的血栓，但能降低机体凝血功能，起到预防新血栓形成的作用，也能在一定程度上防止血栓再次发作。
2.静脉溶栓：对于病程小于72小时的广泛急性近端小腿肌间静脉血栓，可通过静脉点滴尿激酶、链激酶或组织型纤溶酶原激活剂等，将血浆中的纤溶酶原激活转化为纤溶酶，从而溶解血栓。
3.消肿药物：若因小腿肌间静脉血栓导致小腿水肿，可使用迈之灵、七叶皂苷钠等药物来消除水肿、抗炎以及抗渗出，以缓解症状。
三、介入治疗：
1.经导管直接溶栓术：在超声或静脉造影监视引导下，穿刺患侧小腿肌间静脉，把带有侧孔的溶栓导管置入血栓中，通过侧孔持续脉冲式注入溶栓药物尿激酶，让其与血栓充分接触，可获得较好的溶栓效果。
2.下腔静脉滤器植入术：对于有抗凝禁忌或抗凝后出现并发症的患者，可行下腔静脉滤器植入术，通过特殊输送装置放置在小腿肌间静脉血栓处，可阻挡血流中较大的血栓，防止血栓随静脉回流至右心造成肺动脉栓塞。
此外，若因小腿肌间静脉血栓出现下肢水肿，还可采用冷敷等方法，促使血管收缩，减轻局部充血和水肿。
总之，对于小腿肌间静脉血栓的治疗，要根据具体情况选择合适的方法，同时要密切关注病情变化，遵循医生的指导进行治疗和康复。