肝内钙化灶主要是肝细胞损伤后钙质沉积的影像学改变，肝内胆管结石则是肝内胆管中有结石。具体如下：
一、原因不同。
1.肝内钙化灶主要因肝脏发生病变如炎症反应、肝结核、原有肝脏良性或恶性肿瘤退缩坏死等，导致局部钙质沉积形成，且不在胆管内。而肝内胆管结石是在胆管内的结石，多数继发于胆囊结石，主要由胆道感染、寄生虫梗阻、先天性发育畸形等因素引起，与胆道相通，长在胆管里。
二、症状不同。
1.肝内钙化灶通常为良性病变，多数无明显临床症状，常在体检中发现。肝内胆管结石可引发发热、腹痛、黄疸、肝功能损害等症状。
三、检查鉴别。
1.可通过腹部B超、腹部CT及磁共振等检查来鉴别。肝内胆管结石在肝内呈现点状、斑点状、条索状或团块状强回声，沿肝内胆管走行分布，边界不规则，后方常伴声影，肝内某一段或某一叶多处损害，常见肝左叶受累。肝内钙化灶强回声病变可出现在肝实质任何部位，与肝内胆管走行不一致，可伴有声影，其周边肝组织正常，多发生于肝右叶。
四、治疗不同。
1.肝内钙化灶一般不会自行消退也不会继续发展，多数患者无需治疗，定期复查腹部B超、随访观察即可。肝内胆管结石主要以手术治疗为主。
总之，肝内钙化灶和肝内胆管结石在原因、症状、检查表现和治疗方法等方面都存在明显差异，需要准确区分并采取相应的措施。