女孩子小肚子疼的原因有很多，以下是一些可能的原因：
1.排卵性腹痛：青春期女孩在排卵时，卵泡破裂，卵泡液对腹膜可能有一定的刺激作用，所以她们有时会出现左右交替的、每月一次的轻微腹痛。这属于生理性的，表现多为一侧性下腹隐痛、钝痛或坠胀样疼痛，部分少女同时伴有少许阴道出血，即排卵期出血，多在一两天后自行消失，一般不超过七天。这种腹痛多无任何病理改变，妇科检查也完全正常，属于生理性腹痛，一般不需处理。
2.痛经：痛经分原发性与继发性痛经两种。原发性痛经常见于青春期少女，原因与体内前列腺素水平、寒冷、情绪心理因素有关。而继发性痛经常见原因为子宫内膜异位症及子宫腺肌症。表现为疼痛逐渐加重，多呈周期性发作，或非经期下腹有隐痛而行经前后加重。此外，常伴有不孕及月经失调，往往需要药物治疗。
3.妇科炎症：如阴道炎、宫颈炎、盆腔炎、附件炎等，这些炎症都会引起女性下腹疼痛。常见的炎症有：
阴道炎：阴道炎是妇科门诊常见的疾病。临床上以白带的性状发生改变以及外阴瘙痒灼痛为主要临床特点，性交痛也常见，感染累及尿道时，可有尿痛、尿急等症状。
宫颈炎：宫颈炎是育龄妇女的常见病，有急性和慢性两种。急性宫颈炎常与急性子宫内膜炎或急性阴道炎同时存在，但以慢性宫颈炎多见。主要表现为白带增多，呈粘稠的粘液或脓性粘液，有时可伴有血丝或夹有血丝。长期慢性机械性刺激是导致宫颈炎的主要原因。
盆腔炎：女性内生殖器及其周围的结缔组织、盆腔腹膜发生炎症时，称为盆腔炎，包括子宫炎、输卵管卵巢炎、盆腔结缔组织炎及盆腔腹膜炎，可一处或几处同时发病，是妇女常见病之一。由于输卵管、卵巢统称附件，且输卵管发炎时常波及“近邻”的卵巢，因此，又有附件炎之称。盆腔炎分急慢性两种，急性盆腔炎是较为严重的妇科疾病，多在产后、手术后、流产后由病菌感染或经期不注意卫生以及邻近器官疾病（阑尾炎等）蔓延所致；慢性盆腔炎多为急性盆腔炎治疗不及时所致。慢性盆腔炎急性发作时，严重可发展为腹膜炎、败血症，甚至中毒性休克。
附件炎：附件炎是指输卵管和卵巢的炎症。但输卵管、卵巢炎常常合并有宫旁结缔组织炎、盆腔腹膜炎，且在诊断时也不易区分，这样，盆腔腹膜炎、宫旁结缔组织炎，就也被划入附件炎范围了。在盆腔器官炎症中，以输卵管炎最常见，由于解剖部位相互邻近的关系，往往输卵管炎、卵巢炎、盆腔腹膜炎同时并存且相互影响。
4.异位妊娠：异位妊娠也称宫外孕，其中90%发生在输卵管。这样的受精卵不但不能发育成正常胎儿，还会像定时炸弹一样引发危险。宫外孕是妇产科常见的急腹症，近年来发病率有上升趋势。异位妊娠的高危因素有：盆腔炎性疾病史、输卵管手术史、宫内节育器放置史、异位妊娠史、反复人流史等。典型症状为停经后腹痛与阴道流血。
5.肿瘤：肿瘤会引起腹痛，这是女性腹痛的常见原因之一。肿瘤本身的性质、大小、部位，以及肿瘤的发展速度、有无并发症等都可引起腹痛。良性肿瘤多为单侧性、囊性或实性，进展缓慢，一般无腹痛或仅有轻微胀痛。恶性肿瘤多为双侧性、实质性、固定，进展迅速，腹痛呈进行性加剧。常见的肿瘤有：
子宫肌瘤：是女性生殖器官中最常见的一种良性肿瘤，也是人体中最常见的肿瘤之一，又称为纤维肌瘤、子宫纤维瘤。由于子宫肌瘤主要是由子宫平滑肌细胞增生而成，其中有少量纤维结缔组织作为一种支持组织而存在，故称为子宫平滑肌瘤较为确切。简称子宫肌瘤。常见症状有子宫出血、腹部包块、阴道溢液、贫血等。
卵巢肿瘤：卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态，即：一侧性或双侧性、囊性或实性、良性或恶性，其中以囊性多见，有一定的恶性比例。卵巢肿瘤的临床表现，早期多无症状，常在妇科检查时偶然发现。中等大肿瘤常感腹部不适，摸到肿块，由下腹一侧向上长大，妇科检查时在子宫一侧触及球形肿块，囊性或实性，表面光滑，与子宫无粘连，带长者活动自如。巨大肿瘤占满盆、腹腔可出现压迫症状，如尿频、便秘、气急、心悸等。
6.其他：如子宫内膜异位症、节育环下移等也可引起女性下腹疼痛。
总之，女孩子小肚子疼的原因有很多，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。