肛门流水可能由多种原因引起，比如肛瘘，约占肛门疾病的1% - 3%，主要是肛管直肠与肛周皮肤间形成的异常通道导致分泌物流出。
肛瘘导致的肛门流水
肛瘘形成原因： 大多是因肛管直肠周围脓肿破溃或切开后形成，肠道内的细菌等可经内口进入，反复感染形成瘘管。肛瘘表现： 除了肛门流水，还可能有肛周反复肿痛，瘘管外口会间断流出少量脓性、血性、黏液性分泌物，有时会感觉肛门潮湿、瘙痒。
肛周湿疹引发的肛门流水
肛周湿疹诱因： 过敏、局部潮湿、摩擦等都可能引发。比如长期穿不透气的内裤，局部汗液不易蒸发，就容易诱发肛周湿疹。肛周湿疹表现： 肛门周围皮肤会出现红斑、丘疹、水疱，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可出现渗出、流水，皮肤还可能增厚、粗糙。
肠道炎症造成的肛门流水
肠炎类型及原因： 如溃疡性结肠炎，与自身免疫等因素有关；还有感染性肠炎，由细菌、病毒等感染引起。肠炎伴随症状： 除了肛门流水，还可能有腹泻、腹痛等症状，溃疡性结肠炎患者可能有黏液脓血便，感染性肠炎多有急性起病，腹泻次数较多等表现。
痔疮导致的肛门流水
痔疮引发流水情况： 当内痔脱出严重，或者外痔有炎症时，可能会刺激肛门腺体分泌增多，导致肛门流水。痔疮特点： 内痔脱出时，初期可自行回纳，严重时需用手推回甚至无法回纳；外痔可表现为肛门肿物，常有疼痛、瘙痒、异物感等，有时也会有分泌物渗出导致肛门流水。