甲状腺结节的治疗方法需根据结节性质等因素来定。一般来说，约5% - 15%的甲状腺结节为恶性，而良性结节若无症状通常定期观察即可，恶性结节则多需手术等治疗。
一、观察随访
无症状良性结节： 如果甲状腺结节是良性且患者没有明显症状，比如结节较小（直径小于1厘米等情况），医生可能会建议定期（一般3 - 6个月）做甲状腺超声检查，观察结节大小、形态等变化。儿童甲状腺结节： 儿童甲状腺结节需要更密切观察，因为儿童甲状腺结节恶性概率相对较高，通常3 - 6个月就要复查超声。
二、手术治疗
恶性结节： 当甲状腺结节被确诊为恶性时，通常需要手术治疗。比如甲状腺乳头状癌等恶性结节，手术是主要的治疗手段。手术方式会根据结节情况选择甲状腺腺叶切除加峡部切除或者全甲状腺切除等。较大良性结节压迫症状： 如果良性甲状腺结节较大，压迫到周围组织，出现呼吸困难、吞咽困难等症状时，也需要考虑手术切除。例如结节直径大于4厘米，压迫气管导致呼吸不畅，就需要手术解决。
三、药物治疗
甲状腺功能异常伴结节： 如果甲状腺结节伴有甲状腺功能亢进，可能会使用抗甲状腺药物，如甲巯咪唑等，来控制甲状腺激素水平。但药物治疗一般是辅助控制症状，不能使结节消失。如果是甲状腺功能减退伴结节，可能会使用左甲状腺素钠片来补充甲状腺激素。不过药物治疗对于结节本身的消除作用有限，主要是针对甲状腺功能异常进行调整。抑制TSH药物： 对于一些有复发风险的良性结节，有时会使用抑制促甲状腺激素（TSH）的药物，不过需要谨慎使用，因为长期大剂量使用可能会有一些副作用，而且要定期监测TSH等指标以及药物相关不良反应。