喝咖啡本身通常不会直接导致肥胖，但这也与喝咖啡的方式等有关。一般来说，适量喝咖啡本身不太会引发肥胖问题，但如果添加大量糖、奶油等则可能有影响。
咖啡的成分与代谢影响
咖啡因的作用：咖啡中的咖啡因能在一定程度上刺激中枢神经系统，使人体的基础代谢率稍有提升，在短时间内可能让身体消耗的能量比平时略多一点。不过这种影响比较有限，一般每100毫升咖啡中咖啡因含量约为40 - 100毫克左右，单纯靠这点咖啡因带来的基础代谢提升对体重的改变微乎其微。代谢辅助方面：有研究发现，咖啡因可能对脂肪的分解有一定微弱的促进作用，但效果不显著，不能单纯依靠喝咖啡来达到减肥的目的。
不当喝咖啡方式与肥胖关联
添加大量糖的情况：如果喝咖啡时加入很多白砂糖，比如一杯拿铁加入30克以上的糖，那额外摄入的糖分就会转化为脂肪堆积。因为1克糖约提供4千卡能量，30克糖就有120千卡左右的能量，长期大量这样喝咖啡，多余的能量就会转化为脂肪，导致体重增加。搭配高热量食物：如果喝咖啡时还搭配了大量高热量的点心，像奶油蛋糕、甜甜圈等，咖啡本身可能不会直接导致肥胖，但加上这些高热量食物一起摄入，就会使总热量摄入超标，久而久之就容易引发肥胖。比如一个奶油蛋糕约含400千卡能量，再加上一杯加糖的咖啡，热量摄入就容易过剩。
个体差异对喝咖啡与肥胖的影响
代谢率不同的人群：对于代谢率高的人来说，喝咖啡后身体对咖啡因的代谢利用等情况可能让喝咖啡对体重的影响更小；而代谢率低的人，即使喝咖啡，也不能很好地利用咖啡因带来的那点代谢变化，相对更容易因为喝咖啡时的不当搭配等情况出现体重上升。已有基础疾病人群：比如本身有胰岛素抵抗的人，喝咖啡时如果添加大量糖，就会进一步影响血糖代谢，导致身体更易储存脂肪，增加肥胖风险。而本身甲状腺功能亢进的人，基础代谢率本来就高，单纯喝咖啡可能影响不大，但如果同时不注意控制其他高热量食物摄入，也可能因为总热量超标而肥胖。