新生儿黄疸过高危害较大，若血清胆红素水平过高，尤其是未结合胆红素显著升高，可能会对新生儿的神经系统造成损伤。研究表明，当血清未结合胆红素超过一定数值时，就可能透过血脑屏障，引发胆红素脑病。
对神经系统的损害
影响神经细胞功能：过高的胆红素会干扰神经细胞的正常代谢和功能，导致神经细胞的线粒体功能障碍，影响能量产生。例如，会影响神经细胞内的酶活性，使一些重要的生化反应无法正常进行。导致智力发育障碍：严重的胆红素脑病可能会遗留长期的神经系统后遗症，如智力低下、运动障碍、听力障碍等。有数据显示，约10%的胆红素脑病患儿会出现不同程度的智力发育问题。
对其他器官的影响
对肝脏的影响：新生儿黄疸过高会加重肝脏的代谢负担，因为肝脏需要处理过多的胆红素。长期的高胆红素状态可能影响肝脏细胞的结构和功能，导致肝脏的解毒和代谢能力下降。对心血管系统的影响：过高的胆红素可能会影响心血管系统的稳定，导致心率、血压等出现异常变化。例如，可能引起心肌收缩力减弱，影响心脏的泵血功能。
引发严重并发症
胆红素脑病的严重阶段：如果新生儿黄疸过高没有得到及时有效的治疗，病情进一步发展可能进入胆红素脑病的严重阶段，出现抽搐、角弓反张、呼吸衰竭等危及生命的情况。一旦发展到这个阶段，治疗难度极大，预后往往较差。增加感染风险：高胆红素状态会影响新生儿的免疫系统功能，使新生儿更容易发生感染。因为胆红素过高会抑制一些免疫细胞的活性和功能，降低新生儿的抵抗力，从而增加了感染肺炎、败血症等疾病的几率。