血吸虫病的症状因感染阶段不同而有所差异。急性期时，部分患者可能在接触疫水后数小时至2~3天内出现尾蚴性皮炎，表现为尾蚴入侵部位出现红色丘疹，奇痒，1~3天内可自行消退。同时，患者可能有发热症状，热度高低、期限与感染程度有关，多为间歇热或弛张热，体温可在38~40℃，持续数周，可伴有畏寒、盗汗等。还可能出现腹痛、腹泻，一般每天3~5次，个别可达10余次，可伴有黏液血便。
慢性血吸虫病症状
无症状型： 此型较为常见，患者没有明显的自觉症状，一般在体检或因其他疾病就医时发现，通过粪便检查或血清学检查才被确诊。有症状型： 以腹痛、腹泻为常见表现，一般为稀便，偶尔带血，病程长者可出现消瘦、乏力、贫血等表现。部分患者会有肝脾肿大，肝脏以左叶增大较为明显。
晚期血吸虫病症状
巨脾型： 脾脏进行性肿大，质地坚硬，可达到脐平甚至盆腔，常伴有脾功能亢进，表现为白细胞、红细胞、血小板减少，患者面色萎黄，有贫血貌。腹水型： 是晚期血吸虫病肝功能失代偿的表现，患者腹部膨隆如鼓，腹壁静脉曲张，可伴有食欲减退、恶心、呕吐等症状，严重影响患者的生活质量。结肠肉芽肿型： 患者出现腹痛、腹泻、便秘，或腹泻与便秘交替出现，部分患者可触及腹部包块，严重时可导致肠梗阻。侏儒型： 儿童感染血吸虫病后，影响生长发育和生殖系统，导致身材矮小，面容苍老，性功能减退，第二性征不发育等。