扁桃体发炎用药需根据病情来定，一般细菌感染引起的扁桃体发炎，常用青霉素类抗生素，如阿莫西林，一般用药后数天内症状会有所缓解。
细菌感染型扁桃体炎用药
青霉素类药物：如果是A组乙型溶血性链球菌感染引发的扁桃体炎，青霉素是常用药，它能抑制细菌细胞壁合成，起到杀菌作用。比如阿莫西林，对多数敏感菌有较好效果。头孢菌素类药物：头孢拉定也是常用的，属于第一代头孢菌素，对革兰阳性菌有一定抗菌活性，可用于敏感菌导致的扁桃体发炎。
病毒感染型扁桃体炎用药
抗病毒药物：如果是病毒引起的扁桃体炎，像腺病毒感染，目前没有特效抗病毒药物，主要是对症治疗。但像利巴韦林有一定抗病毒作用，可在医生评估后使用。不过病毒感染多为自限性，一般7 - 10天可自行缓解。
对症治疗用药
解热镇痛药：当扁桃体发炎伴有发热、咽痛时，可使用对乙酰氨基酚，它能缓解疼痛和退热，成人一次常用剂量是0.3 - 0.6克，每隔4 - 6小时可重复用药，一天不超过4次。布洛芬也可使用，具有抗炎、解热、镇痛作用，成人一般一次服用0.3 - 0.6克，每6 - 8小时一次。含漱液：可以使用复方硼砂含漱液，能清洁口腔、杀菌消炎，缓解扁桃体发炎引起的不适，每天多次含漱。