珍珠疹通常不需要特殊治疗，一般也没有特定的“最好的治疗方法”，它是一种发生在男性龟头边缘与冠状沟交界处的良性病变。不过如果觉得影响美观等，可考虑以下方式。
观察等待
珍珠疹属于良性病变，一般不会对健康造成影响，很多情况下可以选择观察等待，不需要进行特殊处理。它通常会长期存在，但也不会进一步恶化，所以对于没有不适症状且不影响生活的患者，定期观察即可。
物理治疗方式
激光治疗：
激光治疗是通过激光的高能量作用于珍珠疹组织，使其碳化、坏死脱落。一般治疗后局部会有一定的创面，需要注意保持局部清洁干燥，避免感染，通常创面会在1 - 2周左右愈合。但激光治疗可能会有一定的疼痛感，而且术后需要注意护理，防止感染等并发症。
冷冻治疗：
冷冻治疗是利用低温使珍珠疹组织坏死脱落。冷冻治疗后局部可能会出现肿胀、水疱等情况，一般水疱会在数天内吸收，然后局部组织逐渐恢复。冷冻治疗相对激光治疗来说，疼痛感可能稍轻一些，但也需要注意术后的护理，保持局部清洁，避免搔抓等。
手术治疗情况
手术治疗一般是在其他治疗效果不佳或者患者有强烈要求时才会考虑。手术切除珍珠疹相对来说创伤可能稍大一些，术后需要较长时间的恢复，而且存在一定的手术风险，如出血、感染、瘢痕形成等。所以手术治疗通常是作为最后考虑的方式，需要医生充分评估患者的情况后再决定是否采用手术治疗。