舌头下面起透明小水泡可能由多种原因引起，短时间内出现且无其他严重不适可能是局部刺激等原因，若持续不缓解或伴有其他症状则需重视。
一、黏液腺囊肿导致
多因局部小唾液腺导管阻塞后分泌液潴留形成。常见于喜欢咬舌、咬腮等不良习惯者，表现为舌下透明小水泡，质地软，有弹性。一般无疼痛，但若破裂后会流出黏液，然后可再次肿胀。
二、疱疹性口炎引发
由单纯疱疹病毒感染所致。除舌头下面有透明小水泡外，口腔其他部位也可能有类似损害，还常伴有发热、乏力等全身症状，水泡易破溃形成溃疡，有疼痛不适。儿童感染相对多见，与自身免疫力较低及接触病毒有关。
三、烫伤或创伤性因素
进食过烫食物或牙齿咬伤等创伤，可导致舌头下面出现透明小水泡。有明确的创伤史，水泡大小与创伤程度相关，可能伴有局部疼痛，尤其在进食时可能加重疼痛。各年龄段都可能发生，饮食过急或牙齿咬合异常人群易出现。
四、过敏反应导致
接触某些过敏物质，如食物、药物等，可能引起舌头下面出现透明小水泡，常伴有局部瘙痒等过敏表现，严重时可能有肿胀、呼吸困难等全身过敏症状。过敏体质者更易发生，不同过敏原接触后反应可能不同。