传染性单核细胞增多症主要靠对症支持治疗，一般病程具有自限性，多数患者2~4周可恢复。
一般治疗
休息很重要：患者需要充分休息，避免劳累，一般建议急性期至少休息2~3周，让身体有足够时间恢复。隔离防护：由于该疾病是由EB病毒感染引起，具有一定传染性，发病期间最好隔离，尤其是在急性期，防止病毒传播给他人。
药物治疗
抗病毒药物：更昔洛韦等抗病毒药物可用于治疗，但一般对于免疫功能正常的患者，即使不用抗病毒药物，病情也能自行缓解，所以更昔洛韦等主要用于病情较重或免疫缺陷的患者。对症退热：如果患者有发热症状，体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚等退热药物来降低体温，但要注意按照药物的使用规范来，避免过量使用。
并发症治疗
继发细菌感染时：如果患者在病程中继发细菌感染，如合并链球菌感染，可使用青霉素等抗生素进行治疗，但要先明确有细菌感染依据后再使用，不能盲目应用。比如通过咽拭子培养等检查确诊有链球菌感染后，才考虑使用青霉素。出现脾大时：要避免剧烈运动，防止脾破裂，因为患者可能存在脾大情况，剧烈运动可能诱发脾破裂等严重并发症，一旦出现腹痛等异常情况要及时就医。