怀孕三个月以上进行引产需住院，其大致流程如下：
一、首先需做B超明确胎儿孕周，若怀孕在13周以下可直接住院引产且无需证明；若怀孕达13周及以上，则要开具当地县级以上计生委证明，经医院审核该引产证明合格后才可住院引产。
1.怀孕13周以下：可直接住院引产，不需要额外证明。
2.怀孕13周及以上：开具县级以上计生委证明，医院审核通过才能住院。
二、住院后会检查B超、血常规、肝肾功能等，若均无异常，医生将给予引产药物。
1.小月份（一般五个月之前）：发放口服药物引产，药物服用三天，头两天为软化宫颈药物，第三天为促使子宫收缩药物，通常第三天胎儿可排出。
2.大月份（五个月及以上）：医生会进行羊膜腔穿刺，将引产药物注入羊膜腔内以引发宫缩，一般在引产针打完72小时内胎儿排出。
三、由于胎盘不能自行排净，所以在胎儿排出第二天需进行清宫术，至此整个引产过程结束。清宫顺利的话第二天可出院，引产之后医生可能会依据实际情况给予抗生素预防感染，口服益母草促进子宫收缩。
总之，怀孕三个月以上引产流程较为复杂，涉及多个环节和检查，且不同孕期阶段的引产方式有所不同，术后还需进行相应处理。