两个月没来月经但有褐色分泌物，这可能是妊娠、多囊卵巢综合征、宫颈息肉等情况所致。
一、妊娠：
1.女性怀孕后，在雌孕激素、人绒毛膜促性腺激素等的调控下，子宫内膜会停止周期性增生与脱落，从而出现月经不来的现象。
2.女性受精卵形成后的6-7日，胚胎会植入子宫内膜，在着床过程中，由于受精卵侵入子宫内膜可能会引发少量出血，这属于生理情况，无需治疗。
二、多囊卵巢综合征：
1.本病病因目前并不明确，但医学界认为可能与遗传、代谢、环境等因素有关。
2.其主要表现为排卵功能障碍、高雄激素血症、胰岛素抵抗以及黑棘皮症等。因排卵障碍，进而会导致月经推迟、阴道不规则出血。
3.治疗方法包括通过运动、饮食调整及心理调整等方式有效减重，以改善胰岛素抵抗，促进排卵；进行周期性孕激素治疗；使用炔雌醇环丙孕酮、屈螺酮炔雌醇等药物来保护子宫内膜，缓解高雄激素症状。
三、宫颈息肉：
1.宫颈上会增生出局限性赘生物，息肉会使周围毛细血管扩张。
2.息肉质地柔软，触碰易出血，少量出血在阴道内氧化后会排出褐色分泌物。宫颈息肉一般伴有内分泌失调，会引起月经不来、月经延迟等症状。
3.治疗上需进行阴道镜下宫颈息肉切除术，并遵医嘱服用头孢菌素、阿奇霉素等抗生素药物进行抗感染治疗，且要手术摘除息肉以防恶变。
总之，出现上述情况应及时就医，明确病因后进行针对性治疗，以免延误病情。