六味地黄丸主要用于治疗肾阴亏损、头晕耳鸣、腰膝酸软等症状。现代医学研究发现，它在一些病症的辅助治疗中也有应用。
用于肾阴亏损相关病症
肾阴亏损引发的头晕耳鸣：当人体肾阴不足时，会出现头晕耳鸣的症状，六味地黄丸可以通过滋补肾阴来缓解这种不适。临床观察发现，对于因肾阴亏损导致的头晕耳鸣，服用一段时间六味地黄丸后，约有七成左右的患者症状能得到不同程度的改善。腰膝酸软：肾阴亏虚会使得腰膝失去滋养，从而出现腰膝酸软的情况。有研究表明，服用六味地黄丸4周后，约60%的腰膝酸软患者感觉腰膝部位的不适有所减轻。
在糖尿病并发症中的辅助作用
糖尿病肾病早期：对于糖尿病肾病早期患者，六味地黄丸有一定的辅助保护作用。它可以调节机体的代谢紊乱，延缓糖尿病肾病的进展。在一项小规模临床研究中，服用六味地黄丸6个月的糖尿病肾病早期患者，尿蛋白排泄量较未服用者平均降低了30%左右。糖尿病周围神经病变：糖尿病周围神经病变会出现手脚麻木等症状，六味地黄丸对其有一定的改善作用。部分患者服用后，手脚麻木的频率和程度有所减轻，大约有五成的患者在用药3个月后感觉症状有好转。
用于更年期综合征
缓解潮热盗汗：更年期女性由于雌激素水平下降，易出现潮热盗汗的症状，这与肾阴不足有关。服用六味地黄丸后，约六成的更年期女性潮热盗汗的症状能得到缓解，一般服用2 - 3个月可见一定效果。改善睡眠：肾阴亏虚还可能导致更年期女性睡眠不佳，六味地黄丸能通过滋补肾阴来改善睡眠质量。服用后约有五成的患者睡眠情况有所改善，入睡困难、多梦等症状得到减轻。