马拉色菌毛囊炎主要通过抗真菌药物治疗。一般来说，使用抗真菌药物规范治疗，多数患者可在数周内改善症状。
外用抗真菌药物选择
酮康唑洗剂：可以抑制马拉色菌的生长，洗澡时将其涂抹在患处，停留5 - 10分钟后洗净，每周使用2 - 3次。联苯苄唑乳膏：属于外用抗真菌药，直接涂抹在皮损处，每天1次，连续使用2 - 4周。
口服抗真菌药物情况
伊曲康唑：是常用的口服抗真菌药，对于病情较重的患者可考虑使用，但需要在医生的指导下用药，一般服用时间为1 - 2周。不过，肝功能异常者需要谨慎使用。氟康唑：也可用于马拉色菌毛囊炎的治疗，通常每周服用1 - 2次，连续服用数周，但同样要注意药物对肝脏等器官的影响，需定期监测肝功能。
日常护理要点
保持皮肤清洁：每天用温和的沐浴露清洁皮肤，尤其是容易出汗的部位，如背部、胸部等，保持皮肤干爽。建议选择棉质宽松的衣物，避免衣物过紧不透气，防止马拉色菌滋生。避免搔抓：搔抓患处可能会导致皮肤破损，引起感染加重，要尽量克制自己不要用手抓挠。注意环境卫生：保持居住环境的通风良好，定期清洗更换床单、被罩等，减少马拉色菌的存活环境。