拔智齿第3天反而痛了，可能原因包括生理原因、局部感染以及干槽症。具体如下：
一、生理原因：拔智齿属于开放性手术，需要将智齿与周围牙龈组织剥离，这必然会对该部位造成损伤，从而引发疼痛、肿胀等情况，这属于正常现象。针对这种情况，可以采取冰敷以及适当按摩等方法来缓解疼痛。
二、局部感染：拔智齿后会有创口存在，若患者进食后没有做好消毒处理，就可能致使细菌侵入机体，导致局部感染。治疗上，可在医生指导下服用布洛芬缓释胶囊、人工牛黄甲硝唑胶囊以及扑热息痛等药物。
三、干槽症：临床上干槽症的病因还不明确，但通常与拔牙后创口过大有关，常见症状表现为间歇性疼痛、局部渗血等。对于拔智齿后牙疼的患者，建议及时前往医院，对创口进行深入消毒处理，并在医生指导下使用药物，切不可自行用药。
总之，拔智齿后第3天疼痛加剧可能有多种原因，要根据具体情况采取相应的处理措施，必要时应及时就医诊治。