胃溃疡和十二指肠溃疡的疼痛存在以下区别：一是疼痛部位不同，二是疼痛时间不同。具体如下：
一、疼痛部位
胃溃疡疼痛主要位于中上腹部，也就是剑突下的位置；而十二指肠溃疡的疼痛则处于中上腹部偏右侧。
二、疼痛时间
胃溃疡的疼痛通常发生在餐后，一般经过3-4小时后疼痛会有所减轻，这种情况被称为餐后痛；而十二指肠溃疡的疼痛主要出现在餐前或进食后3至4小时，被称为空腹痛、饥饿痛，也就是两餐之间的疼痛，此外，部分患者还会在夜间出现疼痛。
总结：胃溃疡和十二指肠溃疡在疼痛部位和疼痛时间上有明显区别，了解这些区别有助于对二者进行辨别和诊断。