小儿发烧灌肠的危害主要包括以下几个方面：
1.肠道刺激：灌肠会刺激肠道，引起肠道蠕动增加，可能导致腹痛、腹胀等不适症状。
2.肠道菌群失衡：灌肠可能会破坏肠道内的正常菌群，导致菌群失衡，从而影响肠道的消化和吸收功能。
3.肠道损伤：操作不当或使用不恰当的灌肠液可能会导致肠道黏膜损伤，甚至引起肠道穿孔等严重并发症。
4.过敏反应：某些小儿可能对灌肠液中的药物或成分过敏，引起过敏反应，如皮疹、呼吸困难等。
5.交叉感染：如果灌肠器械消毒不彻底或操作过程中不注意卫生，可能会引起交叉感染，如肠道感染、血液感染等。
6.其他风险：灌肠可能会影响小儿的心理状态，引起恐惧、不安等情绪反应。
需要注意的是，虽然小儿发烧灌肠存在一定的危害，但在某些情况下，如小儿高热不退、严重呕吐或腹泻等，灌肠可能是一种有效的治疗方法。在进行灌肠治疗时，医生会根据小儿的具体情况选择合适的灌肠方法和灌肠液，并严格按照操作规程进行操作，以减少危害的发生。同时，家长也应该密切观察小儿在灌肠后的反应，如有异常应及时告知医生。
此外，对于小儿发烧，除了灌肠治疗外，还可以采取其他治疗方法，如口服退烧药、物理降温等。在治疗过程中，家长应该注意保持小儿的水分摄入，让其多休息，同时密切监测体温变化，根据病情及时调整治疗方案。如果小儿发烧持续时间较长或伴有其他严重症状，应及时就医，以便得到更专业的治疗。