HPV感染大多数人没有明显症状，约70%-80%的人感染HPV后，在2年内会被自身免疫系统清除，不会出现明显病变。但少部分持续感染的人可能会有一些表现。
皮肤低危型HPV感染症状
寻常疣：表现为突出皮肤表面的丘疹，一般呈灰褐色或棕色，表面粗糙，质地坚硬，大小不等，数目不定，可以发生在身体的任何部位，比如手部、足部等。跖疣：发生在足底的寻常疣，多由人乳头瘤病毒1型感染引起，表现为足底出现圆形灰黄色角质斑块，周围绕以稍高的角质环，去除角质层后，其下方有疏松的角质软芯，可见毛细血管破裂出血而形成的小黑点。
皮肤高危型HPV感染症状
鲍温样丘疹病：多见于青壮年，表现为多个或单个色素性丘疹，呈圆形、椭圆形或不规则形，大小不等，颜色可呈棕红、褐黑或黑色，好发于腹股沟、外生殖器及肛周等部位。疣状表皮发育不良：多在幼年发病，表现为全身泛发的扁平疣状丘疹，颜色为暗红、紫红或褐色，数目逐渐增多，分布广泛，可累及面部、颈部、手背等部位。
黏膜低危型HPV感染症状
生殖器疣（尖锐湿疣）：主要由HPV6型、11型等感染引起，好发于生殖器及肛门周围等部位，初期为单个或多个淡红色小颗粒，质地柔软，顶端尖锐，随后可逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等外观，表面易发生糜烂、渗液、出血等情况。
黏膜高危型HPV感染症状
宫颈上皮内瘤变：大多数人没有明显症状，部分人可能出现阴道异常出血，如性生活后出血、月经间期出血等，还可能有阴道分泌物增多等表现。如果病情进一步发展，可能会出现下腹部疼痛等症状，但这些症状也可能由其他妇科疾病引起，需要通过宫颈细胞学检查、HPV检测及阴道镜活检等才能明确诊断。