肛门口有个肉疙瘩很疼，一般可能是由血栓性外痔、肛周脓肿、毛囊炎等原因导致。具体如下：
一、血栓性外痔：这是较为常见的肛肠科疾病。当外痔或混合痔伴发急性血栓形成以及肛门剧痛时，就被称为血栓性外痔。通常会表现为肛周出现暗紫色的卵圆形肿物，其表面皮肤水肿且质地硬，在急性期往往伴有极为剧烈的肛门疼痛。所以，患者肛门口出现的肉疙瘩很疼可能是血栓性外痔引起的。
二、肛周脓肿：指的是直肠肛管周围软组织内或其周围间隙发生急性化脓性感染并形成脓肿。这种情况可能致使患者肛门口有个肉疙瘩且很疼，还多伴有局部发热、溃烂等不适症状。
三、毛囊炎：它是常见的毛囊炎症性皮肤病，可在身体任何毛囊部位发生。如果患者长时间穿着不透气内裤或久坐，同时又不注重局部清洁卫生，那么肛门及其周围皮肤可能受到病菌感染，从而引发毛囊炎，导致肛门口出现肉疙瘩且伴有疼痛。
总之，当肛门口出现肉疙瘩且很疼时，可能是上述多种原因引起，应及时就医进行明确诊断和针对性治疗。