右附件囊肿的成因较多，其中生理性因素较为常见，比如在月经周期中，黄体形成过程中可能形成黄体囊肿，这种情况通常会在月经结束后自然消失，一般无需特殊处理。
生理性因素相关
排卵相关囊肿：女性排卵后，卵泡壁塌陷，卵泡液流出，卵泡壁皱缩形成黄体。如果黄体血肿液化，就可能形成黄体囊肿，一般直径多在3~5厘米，多数在月经来潮后会自行缩小或消失。滤泡囊肿：这是最常见的生理性囊肿，是由于卵泡不成熟或者成熟后不排卵，卵泡持续存在而形成的，一般直径通常小于5厘米，多数也会在2~3个月经周期内自行消退。
病理性因素相关
炎症性囊肿：盆腔炎症波及右侧附件时，炎症刺激会导致输卵管伞端粘连，分泌物积聚形成输卵管卵巢囊肿。这种囊肿往往伴有下腹部疼痛、发热等症状，炎症消退后囊肿有可能缩小，但有时也需要进行抗炎等治疗。子宫内膜异位囊肿：异位的子宫内膜种植在右侧卵巢上，随着月经周期反复出血，形成囊肿，囊肿内含有暗褐色、似巧克力样的陈旧血性液体，所以也叫卵巢巧克力囊肿。患者多有进行性加重的痛经表现，囊肿大小不一，有的可逐渐增大。
其他因素相关
内分泌失调：长期的内分泌紊乱可能影响卵巢的正常功能，导致卵巢组织异常增生形成囊肿。比如体内雌激素水平过高，就可能刺激卵巢组织增生形成囊肿。一些患有多囊卵巢综合征的女性，也可能出现附件囊肿的情况。遗传因素：部分附件囊肿具有一定的遗传倾向，如果家族中有相关囊肿病史，个体患右附件囊肿的风险可能会相对较高。比如某些遗传性肿瘤综合征可能与附件囊肿的发生有关。